当社は、嘉吉年間（1441～1445）に西国主、赤松権太夫の守護神として創建されたと伝えられている。
　赤松氏の滅亡後の天正８年赤松氏家臣、河本光利の子、光信が社殿を造営して再興した。
　もとは、大森天神と称したが、明治元年に菅原神社と改称した。
　明治８年火災によって社殿、宝庫等を焼失したが、同年１２月に再建したものが現在の社殿である。
　延享２年迄は妙福寺、明治２年迄は妙泉寺がそれぞれ別当職として奉仕した。